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科学家基于栎属青冈组系统学揭示新近纪东亚亚热带常绿林演化动态 - 生物研究专区 - 生物谷

时间:2018-01-04 人气:0
科学家基于栎属青冈组系统学揭示新近纪东亚亚热带常绿林演化动态-生物研究专区-生物谷
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科学家基于栎属青冈组系统学揭示新近纪东亚亚热带常绿林演化动态
来源:上海生科院2017-12-1018:16
简化基因组测序(Reduced-RepresentationGenomeSequencing,RRGS)顾名思义是对部分基因组进行序列测定。它是指利用生物信息学方法,设计标记开发方案,富集特异性长度片段,应用高通量测序技术获得海量标签序列来代表目标物种全基因组信息的测序方法。常绿阔叶林除在维持生态平衡和生物多样性、区域气候稳定等方面具有重要生态功能外,与人类的生产生活息息相关。认识常绿阔叶林的历史动态有助于预测未来气候变化对常绿阔叶林的组成及分布的影响,并可为生物多样性的保护提供重要信息。栎属青冈组QuercussectionCyclobalanopsis特有分布于东亚,为此区域常绿阔叶林的建群种,是研究东亚常绿阔叶林演化的理想材料。中国科学院上海辰山植物科学研究中心辰山植物系统与进化研究组利用简化基因组测序产生的直系同源序列,重建了栎属青冈组的系统关系及生物地理演化。系统发育树显示栎属青冈组为单系类群,组内的分支跟形态解剖性状相对应,分为2个大支,6个小支;基于化石矫正的分化时间分析显示,青冈组在渐新世末期开始分化,这与喜马拉雅的隆升及中南半岛板块横向挤压的时间相吻合;青冈组的多样化速率在中新世末期最高;中新世中期适宜的气候及东亚夏季风的加强促进青冈组从中国-喜马拉雅区和古热带区向中国-日本区的扩散。研究结果显示,新近纪的气候变化及印度和欧亚板块碰撞引起的地质活动,对东亚常绿阔叶林的时空演化具有重要的影响。相关研究结果以PhylogenyandbiogeographyofEastAsianevergreenoaks(QuercussectionCyclobalanopsis;Fagaceae):insightsintotheCenozoichistoryofevergreenbroad-leavedforestsinsubtropicalAsia为题,在线发表在MolecularPhylogeneticsandEvolution上。研究工作得到了国家自然科学基金和上海市绿化和市容管理局项目的支持。(生物谷Bioon.com)
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